EVENTO
Projeto BioPAUÁ: um Portal para Dinâmica Molecular Usando um Ambiente de Grade Computacional
Tipo de evento: Seminário LNCC
Apresentamos a primeira versão operacional do Projeto BioPAUÁ, um portal para aplicações em Dinâmica Molecular (DM) num ambiente de gradecomputacional. O objetivo do Portal BioPAUÁ consiste na disponibilização de um ambiente Web para facilitar o desenvolvimento de pesquisas na área de DM, com um especial foco na investigação de complexos proteína/ligante. Para tanto, é nosso desejo introduzir especialistas não afeitos a simulações computacionais, de áreas tais como biologia molecular e farmacologia, de uma forma mais amigável e eficiente, nas técnicas de DM, por meio do programa GROMACS. Outra característica única deste projeto e a utilização da infra-estrutura de grade computacional do Projeto PAUÁ, que é baseada no middleware MYGRID e cuja rede está espalhada pelo Brasil. O portal oferece o serviço de submissão de jobs, cujas simulações poderão ser feitas utilizando-se apenas um arquivo do tipo PDB como entrada, ou a partir de um arquivo tipo TPR, para usuários já experientes na utilização do pacote GROMACS. Este projeto foi desenvolvido no LNCC/MCT em colaboração com o IBCCF/UFRJ (Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular) e apoio da HPdo Brasil P&D.
Data Início: 30/03/2005 Hora: 14:00 Data Fim: Hora: 16:00
Local: LNCC - Laboratório Nacional de Computação Ciêntifica - Auditorio A
Comitê Organizador: Alan Wilter S. da Silva - LNCC (Projeto BIOPAUÁ) - LNCC - alan@lncc.br Patrícia M. de Barros - LNCC (Projeto BIOPAUÁ) - LNCC - patricia@lncc.br
Apoio Financeiro: HP do Brasil P&D
